Dezynfekcja wody metodami chemicznymi polega na dawkowaniu utleniaczy. Utleniacze te w pierwszej kolejności utleniają substancje mineralne i organiczne. Jedną z metod jest dezynfekcja wody chlorem. Chlor jest jedynym z najsilniejszych środków bakteriobójczych. Oprócz siły bakteriobójczej dezynfekcja wody chlorem jest również bardzo tania i nie wymaga dużego nakładu czasu. Te czynniki sprawiają chlorowanie wody jest najbardziej rozpowszechnioną metodą. Wodę najczęściej chloruje się, stosując chlor gazowy, który dodawany do dezynfekowanej wody w postaci wody chlorowej, która jest przygotowywana i dawkowana ze specjalnych urządzeń zwanych chloratorami.